T
Arial
Verdana
Tahoma
Trebuchet
Times New Roman
Georgia
Garamond
Courier New
Brush Script MT
Topoisomeraas
Kasutatud lausetes (
Bioloogia)
DNA replikatsiooni alguspunkt- origin punktid, AT rikkad järjestused replikatsiooni mull-
topoisomeraas
on kaksikahela lahti keeranud, helikaas lõhub vesiniksidemed ja tekib replikatsiooni mull replikatsiooni kahvel- Replikatsioon toimub alguspunktist lähtuvalt kahes suunas, moodustub kaks Y-kujulist struktuuri.
Valgu sünteesi pärssimine (III) Valgu sünteesi pärssimise korral on antibiootikumide ründepunktid erinevad: §Tetratsükliin takistab tRNA seostumist 30S ribosoomiga ja 30S initsiatsioonikompleksi moodustamist (bakteriostaatiline) §Aminoglükosiidid takistavad valgu süntees seostudes 30S ja vähem 50S ribosoomiga - koodi valesti lugemine (bakteriotsiidsed) §Klooramfenikool, makroliidid, klindamütsiin takistavad 50S ribosoomile seostudes peptiidahela korrektset moodustumist translatsioonil (bakteriostaatilised) Nukleiinhapete sünteesi pärssimine (IV) § DNA replikatsiooni takistamine toimub
topoisomeraas
I ja güraasi pärssimise kaudu - takistatud supercoling (nalidiksiinhape, ciprofloksatsiin, ofloksatsiin).
Replikatsioon bakterites: helikaasid keerutavad biheeliksi lahti; lahtikeerdumist kompenseerivad
topoisomeraas
; DNA polümeraas III kasutab RNA-praimereid; DNA primaas sünteesib oligonukleotiidsed RNA-praimerid.
Mittehistoonsete kromosoomivalkude hulka kuuluvad DNA
topoisomeraas
id, HMG valgud, teatud DNA-ga järjestsspetsiifiliselt seonduvaid valke, RNA polümeraasid, DNA süntetaasid ja proteiinkinaasid.
Positiivse superspiralisatsiooni puhul (seda tekitab näiteks
topoisomeraas
I) kulub ühe DNA heeliksi täispöörde saavutamiseks vähem aluspaare.
* Imetaja DNA replikatsiooni kahvel (vt ka seminari materjali) 3` 5` 3` Topoisomeraas I liudklamber liugklamber Keerab ahela lahti 3 5 ` ` Klaambri laadur 5 ` Inimese rakutuumas sünteesitakse juhtiv ja mahajääv ahel Pol ja Pol abil ning mitokondris Pol abil. keerab ahela lahti.
Topoisomeraasid ja güraasid - ensüümid, mis võivad tekitada või kõrvaldada superspiraale.
Replikatsiooni viib läbi viiruse kodeeritud ensüümkompleks (vähemalt kümne viiruse geeni produktid, sh polümeraas, ligaas,
topoisomeraas
, RFC), millesse ilmselt kuulub ka peremeesraku komponente.
Topoisomeraas (güraas) - eelnevad ja järgnevad polümeraasile, et leevendada despiraliseerumisest tingitud pingeid 2.
Negatiivse puhul on ahelad rohkem lahti keerdunud ja võivad isegi eralduda.
topoisomeraas
mis
viib DNA kaksikheeliksisse kaksik-või üksikalhelalisi katkeid ning lõdvendavad või pingutavad kaksiheeliksit.
III ja ja ei 1020 ·Polümeraas I ja III replikatsioon 5' 3' ·Polümeraas II roll ei ole päris selge ·3' 5' eksonukleaas = võime nukleotiide eemaldada 3' otsast ·Oluline korrektuuri lugemises ( proofreading) ·Ilma selleta vigade määr (mutatsioonid) 1 x 106 ·Koos korrektuuriga 1 x 109 (1000kordne efekt) ·5' 3' eksonukleaasne aktiivsus replikatsiooni repareerimises Replikatsiooni algus (prokarüoodil): Algab kaksikahela denaturatsioonist, nii saab alguse lämmastikalauste ekspositsioon Replikatsioon kahes suunas ~245 bp E. coli Initsiatsioon: Üheahelalisi DNA lõike nimetatakse matriitsideks Güraas on ensüüm (
topoisomeraas
), mis vabastab superspiralisatsiooni Initseeriv valk ja DNA helikaas seonduvad DNAga replikatsiooni kahvlis ja toimub lahtikeerdumine.
DNA ahela keerdumise probleemid, mis tekivad DNA replikatsiooni korral DNA torionaalne pingestumine → tekib lahtikeerdumisel Torsioonjõudude leevendamiseks tekitavad
topoisomeraas
valgud
DNA ajutised ahela katked 21.
Ensüümid: · Helikaas keerab DNA biheeliksi lahti · DNA güraas e.
topoisomeraas
kompenseerib lahtikeerdumist (aitab struktuuri hoida) · DNA-polümeraasid vastutavad polünukleotiidahelate sünteesi eest 5'->3' suunas o - 4 subühikut, polümeraasi tootlikus, pole 3' eksonukleaasi aktiivsust o - vigade parandus o - replitseeriv ensüüm mitokondrites o - peamine polümeraas!
· Helikaas keerab DNA biheeliksi lahti · DNA güraas e.
topoisomeraas
kompenseerib lahtikeerdumist (aitab struktuuri hoida) · DNA-polümeraasid vastutavad polünukleotiidahelate sünteesi eest 5'->3' suunas o - 4 subühikut, polümeraasi tootlikus, pole 3' eksonukleaasi aktiivsust o - vigade parandus o - replitseeriv ensüüm mitokondrites o - peamine polümeraas!
Replikatsioonil tekivad superspiraalid replikatsioonikahvli ette positiivne superspiraal replikatsioonikahvli taha negatiivne superspiraal
topoisomeraas
ensüümid
kõrvaldavad superspiraalid
topoisomeraas
I tekitab DNA üheahelalisi katkeid
topoisomeraas
II tekitab DNA kaheahelalisi katkeid
topoisomeraas
ide inhibiitoreid
kasutatakse laialdaselt vähivastases kemoteraapias.
Selgitage ensüüm DNA güraasi (
topoisomeraas
II) rolli DNA tertsiaarse struktuuri kujundamisel.
DNA kõrgemat järku struktuurid ja ensüümid: Topoisomeraas 1 – tekitab DNA-s üheahelalisi katkeid.
Sulfonüülamiid-inhibeerib foolhappe sünteesi DNA
topoisomeraas
ide inhibitsioon
Norfloksatsiin Rakukesta sünteesi inhibitsioon Penitsiliin, Vankomütsiin Antibiootikumide väljatöötamise ajalugu Sulfonüülamiidid.
Milliseid ensüüme järgnevast valikust saaks rakendada: a) DNA
topoisomeraas
I b) DNaas I c) DNA polünukleotiid kinaas d) DNA ligaas e) T7 DNA polümeraas 10.
DNA superspiralisatsioonil osalevad ensüümid, mida nimetatakse
topoisomeraas
ideks.
topoisomeraas
id viivad
DNA kaksikheeliksisse kas üksik- või kaksikahelalisi katkeid ning lõdvendavad või pingutavad kaksikheeliksit.
Superheeliksi struktuur kaitseb DNA-d DNAaaside eest (
topoisomeraas
i toimel
moodustub) Heterokormatiin- inaktiivne DNA, tsentromeeri ja telomeeri piirkond Eukromatiin-aktiivne DNA 2.
[Loomse oksoliinhappe derivaadid) raku DNA
topoisomeraas
e ei pärsi, kuna vähenemine (poriinide muutused).
Torsioonjõudude leevendamiseks on vaja DNA ahelal katkete tekitamine- seda teevad
topoisomeraas
valgud
.
DNA
topoisomeraas
id teevad
DNA ahelatesse ajutisi katkeid, et soodustada DNA ahelate lahtikeeramist.
DNA superspiralisatsiooni tekitavad
topoisomeraas
id.
Güraas on ensüüm (
topoisomeraas
), mis vabastab superspiralisatsiooni.
Liited
Sõnapaarid
Kirjapilt
.