T
Arial
Verdana
Tahoma
Trebuchet
Times New Roman
Georgia
Garamond
Courier New
Brush Script MT
Isomeraas
Kasutatud lausetes (
Keemia)
Koensüümid ja vitamiinid Ensüümide klassifikatsioon Looduses esineb tohutu hulk erinevaid ensüüme Enamikule on antud triviaalnimetused Osad triviaalnimetused viitavad katalüüsitavale reaktsioonile (trioosfosfaadi
isomeraas
) teised mitte (trüpsiin) Ensüümide Komisjoni (EC) poolt on välja töötatud ensüümide nimetamist ja klassifitseerimist võimaldav loogiline süsteem Ensüümi süstemaatiline nimetus baseerub katalüüsitaval reaktsioonil Biokeemias leiavad kasutamist eelkõige triviaalnimetused Ensüümi nimetus lõpeb alati sufiksiga -aas Ensüümi nimetus: substraat(+aas) või (+protsess aas) amülaas alkoholi dehüdrogenaas Ensüümide klassifitseerimine põhineb katalüüsitaval reaktsioonil ensüümid jagunevad kuude põhiklassi 1.
Polaarsed neutraalsed on tavaliselt pinnal kuid ka gloobuli sees, kus moodustavad H sidemeid Tsütokroom C koos seostunud heemiga Valkude sekundaarstruktuuri elemendid kombineeritakse erinevatel viisidel Hemoglobiin Konkanavaliin A Trioosfosfaadi
isomeraas
valkude
sekundaarstruktuuri elemendid moodustavad supersekundaarstruktuure ehk motiive 1. motiiv 2. juuksenõel 3. motiiv 4. tünnid Valkude, mis on suuremad kui 200 ah jääki, piires moodustuvad tavaliselt struktuurselt iseseisvad klastrid ehk domeenid Domeen on iseseisvalt kokkupakkuv struktuuriühik Väiksemad valgud koosnevad ühest suuremad aga mitmest domeenist Pöörded ja aasad ehk lingud Moodustavad olulise osa globulaarsete valkude struktuurist.
DNA kõrgemat järku struktuurid ja seda mõjutavad ensüümid helikaasid, topo
isomeraas
id II Valgu biosüntees e. geneetiline translatsioon Nagu eespool kirjas, seisneb geneetiline translatsioon nukleiinhapetes kodeeritud geneetilise informatsiooni (nukleotiidse järjestuse) tõlkimises valkude aminohappeliseks järjestuseks.
Põhjuseks on defektsed maleüülatsetoatsetaadi
isomeraas
ja fumarüülatsetoatsetaadi hüdrolaas.
Renatureerumist kiirendavad mitmed ensüümid (valgu disulfiid
isomeraas
, peptidüül-prolüül
isomeraas
id), mis kiirendavad disulfiidsidemete vahetust või proliini konformatsiooni muutust.
Etanoolikäärimine: - On teine glükoosi anaeroobse katabolismi vorm - Inimorganismis ei toimu - Toimub mõnede bakterite ja pärmide ensüümide toimel - Ka alkoholkäärimise roll seisneb ATP tootmises anaeroobsetes tingimustes - On piimhappe-käärimine - Püruvaat -> atseetaldehüüd -> etanool Ensüümid, mis katalüüsivad anaeroobset glükolüüsi (mõni näide). - Heksoosi kinaas (Mg2+) - Fosfoglükoosi
isomeraas
(Mg2+) - Fosfofruktoosi kinaas (Mg2+) - Aldolaas A - Trioosfosfaadi
isomeraas
- GAP dehüdrogenaas - Fosfoglütseraadi kinaas (Mg2+) - Fosfoglütseraadi metaas - Enolaas - Püruvaadi kinaas (Mg2+ ja K+) Aeroobne glükolüüs.
1) Glc-6-P teke Ensüümiks heksoosi kinaas, regulatoorne ensüüm 2) Glc-6-P isomeriseerub Fru-6-P-ks Ensüümiks fosfoglükoosi
isomeraas
3) Fru-1,6-bisP teke Ensüümiks anaeroobse glükolüüsi keskne ensppm fosfofruktoosi kinaas 4) Fru-1,6-bisP lõhustumine trioosfosfaatideks Aldolaas A lõhustav toime annab DAP-di ja GAP-di 5) DAP isomeriseerumine Ensüümiks trioosfosfaadi
isomeraas
isomeriseerib
DAP-di GAPiks, kuna glükolüütiliselt on lõhustatav vaid GAP 6) GAP oksüdatsioon Ensüümiks GAP dehüdrogenaas, oksüdeerib GAPi aldehüüdrühma makroergilist fosfaati kandvaks karboksüülrühmaks.
Ensüümid, mis katalüüsivad anaeroobset glükolüüsi: Heksoosi kinaas, fosfoglükoosi
isomeraas
, fosfofruktoosi kinaas, püruvaadi kinaas.
Ülalnimetatud disulfiidi
isomeraas
kuulub
samuti nende hulka, sest disulfiidsildade õige moodustumine on samuti eelduseks õige konformatsiooni saavutamisele.
Hsc70 (chaperon) Kalneksiin (chaperon) PDI (proteiin disulfiidi
isomeraas
) PPI (peptidüül-prolüüli
isomeraas
) Kirjeldage signaaljärjestust valgu liikumiseks tsütosoolist ER-i, milliste teiste valkudega signaaljärjestus komplekseerub?
Renatureerimist kiirendavad ensüümid – valgu disulfiidi
isomeraas
, peptidüül-prolüül
isomeraas
id – kiirendavad disulfiidsidemete vahetust või proliini konformatsiooni muutust.
Selgitage ensüüm DNA güraasi (topo
isomeraas
II) rolli DNA tertsiaarse struktuuri kujundamisel.
Neil puuduvad fruktoosfosfaadi aldolaas ja trioosfosfaadi
isomeraas
.
Kokkupakkumist assisteerivad ensüümid: Peptidüülprolüül
isomeraas
disulfiidi
isomeraas
Ðaperonid (E.coli GroEL-GroES) Hemoglobiin ja müoglobiin Hemoglobiin- hapniku transportimine veres.
Klassifikatsioon (toime järgi): oksiidoreduktaasid , transferaasid, hüdrolaasid (kõige rohkem puutume kokku), lüaasid,
isomeraas
id, ligaasid (süntetaasid).
Ensüümid (topo
isomeraas
id, güraasid) võivad luua või kõrvaldada superspiraale.
Isomeeride moodustumist katalüüsib zeatiini
isomeraas
.
Glükoos 6-fosfaadi
isomeraas
glükolüüsi
raja teine reaktsioon on isomerisatsioon, mille käigus G6P konverteeritakse fruktoos 6-fosfaadiks (F6P).
Sellega tegeleb glükoosfosfaadi
isomeraas
.
Ülalnimetatud disulfiidi
isomeraas
kuulub
samuti nende hulka.
Fosfoglükoosi
isomeraas
(Mg2+) 3.
Glükoos -6-P (Isomeraas) Glükoos-1-P 3.
PG kinaas GAP dehüdrogenaas 3-PG (ATPADP) 1,3-BPG -(NADPHNADP++ Pi) GA-3-P trioosfosfaadi
isomeraas
gap
enediool------------------ DHAP aldolaas GAP + DHAP ------------ fruktoos-1,6-fosfaat fruktoos-1,6-bisfosfataas fruktoos-1,6-bisfosfaat ------------------------- fruktoos-6-fosfaat 7.
Liited
Sõnapaarid
Sõnapaarid
fosfoglüko+isomeraas
topo+isomeraas
Kirjapilt
.